Amoxcalli se suscribe a los lineamientos éticos que el Comité de Ética para Publicaciones (COPE por sus siglas en inglés) propone para los actores involucrados en el proceso de publicación. Además del director y los editores de la revista, se cuenta con el apoyo de un Comité Científico Internacional y un Comité Editorial compuesto por investigadores de la Facultad de Filosofía y Letras de la BUAP.

Como parte de las reglas seguidas por Amoxcalli los revisores emplean una herramienta antiplagio proporcionada por el servicio de bibliotecas de la BUAP. En caso de detección de plagio se comunicará de inmediato al autor. Si se trata de frases o fragmentos de extensión breve y el autor responde con una explicación satisfactoria para los evaluadores, será posible admitir nuevamente el artículo para su revisión con las debidas correcciones. En caso de no obtener respuesta, la colaboración será rechazada, se informará a la víctima del plagio y/o a los superiores de quien realizara el plagio.